Bagi mewujudkan tadbir urus organisasi yang mantap dan seterusnya menzahirkan perkhidmatan yang cemerlang, organisasi PERDA telah distrukturkan kepada tiga cabang dengan fungsi dan aktiviti seperti berikut :
(klik pada nama Bahagian / Unit untuk keterangan fungsi dan aktiviti)
(klik pada nama Bahagian / Unit untuk keterangan fungsi dan aktiviti)
Sektor Pengurusan
- Bahagian Khidmat Pengurusan
- Bahagian Kewangan
- Bahagian Perancangan Strategik
- Bahagian Teknologi Maklumat
Sektor Pembangunan
Pengurus Besar
- Institut Kemahiran Tinggi PERDA (PERDA-TECH)
- Unit Audit Dalam
- Unit Pelaburan
- Unit Perhubungan Awam
- Unit Undang-Undang